Lalu pada tanggal 1 April 1999, secara resmi Polri terpisah dari tiga angkatan lainnya, dan ABRI berubah menjadi TNI. Sejak itu pula, Akademi Kepolisian terpisah dari AKABRI.
AKABRI kemudian diubah namanya menjadi Akademi TNI, yang terdiri dari Akmil, AAL, dan AAU.
Berdasarkan Perpang Nomor: Perpang/ 28/ V/ 2008 tanggal 12 Mei 2008, Pendidikan Dasar Keprajuritan Chandradimuka dan Integratif Akademi TNI pola 12 bulan langsung di bawah Mako Akademi TNI.
Kemudian, Akmil menyelenggarakan pendidikan khusus Taruna Angkatan Darat tingkat II, III, dan IV.***